home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Shareware Overload Trio 2 / Shareware Overload Trio Volume 2 (Chestnut CD-ROM).ISO / dir26 / med9410b.zip / M94A0219.TXT < prev    next >
Text File  |  1994-10-08  |  3KB  |  43 lines
  1.        Document 0219
  2.  DOCN  M94A0219
  3.  TI    Identification of a novel HIV-1 TAR RNA bulge binding protein.
  4.  DT    9412
  5.  AU    Baker B; Muckenthaler M; Vives E; Blanchard A; Braddock M; Nacken W;
  6.        Kingsman AJ; Kingsman SM; Glaxo Group Research and Development Ltd,
  7.        Greenford, Middlesex,; UK.
  8.  SO    Nucleic Acids Res. 1994 Aug 25;22(16):3365-72. Unique Identifier :
  9.        AIDSLINE MED/94359809
  10.  AB    The Tat protein binds to TAR RNA to stimulate the expression of the
  11.        human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) genome. Tat is an 86 amino
  12.        acid protein that contains a short region of basic residues (aa49-aa57)
  13.        that are required for RNA binding and TAR is a 59 nucleotide stem-loop
  14.        with a tripyrimidine bulge in the upper stem. TAR is located at the 5'
  15.        end of all viral RNAs. In vitro, Tat specifically interacts with TAR by
  16.        recognising the sequence of the bulge and upper stem, with no
  17.        requirement for the loop. However, in vivo the loop sequence is critical
  18.        for activation, implying a requirement for accessory cellular TAR RNA
  19.        binding factors. A number of TAR binding cellular factors have been
  20.        identified in cell extracts and various models for the function of these
  21.        factors have been suggested, including roles as coactivators and
  22.        inhibitors. We have now identified a novel 38 kD cellular factor that
  23.        has little general, single-stranded or double-stranded RNA binding
  24.        activity, but that specifically recognises the bulge and upper stem
  25.        region of TAR. The protein, referred to as BBP (bulge binding protein),
  26.        is conserved in mammalian and amphibian cells and in Schizosaccharomyces
  27.        pombe but is not found in Saccharomyces cerevisiae. BBP is an effective
  28.        competitive inhibitor of Tat binding to TAR in vitro. Our data suggest
  29.        that the bulge-stem recognition motif in TAR is used to mediate cellular
  30.        factor/RNA interactions and indicates that Tat action might be inhibited
  31.        by such competing reactions in vivo.
  32.  DE    Animal  Base Sequence  Binding Sites  Binding, Competitive  Cell
  33.        Nucleus/CHEMISTRY  CHO Cells  Factor Xa/METABOLISM  Gene Products,
  34.        tat/*METABOLISM  Hamsters  Hela Cells  Human  HIV-1/*GENETICS  Molecular
  35.        Sequence Data  Nucleic Acid Conformation  Peptide Fragments/METABOLISM
  36.        RNA-Binding Proteins/*ANALYSIS/CHEMISTRY/METABOLISM  RNA,
  37.        Viral/CHEMISTRY/*METABOLISM  Species Specificity  Structure-Activity
  38.        Relationship  Support, Non-U.S. Gov't  JOURNAL ARTICLE
  39.  
  40.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  41.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  42.  
  43.